北京口碑好对样本进行宏病毒组测序宏基因组

上海探普生物科技有限公司对样本进行宏病毒组测序以后的数据分析是如何进行的？

寄生性质的生物下机数据一般都伴随大量的宿主和其他微生物的数据。探普生物基于该特点，优化了自有数据库，搭载了**的生物信息学分析流程，可处理复杂背景下的目标物种序列。生物信息学流程主要包括，1，对样本进行宏病毒组测序，基于数据库，去除宿主数据和其他微生物数据，筛选出目的序列，然后进行序列组装，物种分类，丰度统计。样本数量达到一定标准还可以进行差异分析。现有数据库不够完善，出于对数据真实性的尊重，探普生物一般不进行功能相关的分析。预测性质的分析可以根据具体项目评估数据库质量后进行。

探普生物研发团队潜心在病原微生物尤其是病毒这一重要细分领域钻研，经过数批各种来源的样本测试，开发了整套基于illumina高通量深度测序平台，特异、高效的针对分离培养和临床标本的病毒核酸的测序实验及分析流程。基于无差别的样本处理方式和独特的生物信息学分析流程，除了对于被宿主核酸污染的病原微生物/病毒核酸样本进行全基因组和宏基因组测序之外，未知病原、不明原因的***也在探普特有的流程下可以得以鉴别

会对样本进行宏病毒组测序有什么意义？

 和细菌的宏基因组相似，病毒宏基因组也是旨在研究微生物群体中的物种分布规律和差异，通过大数据分析微生物群体的功能。通过对样本进行宏病毒组测序，我们可以了解单个样本里有什么病毒，相对含量是多少，优势物种是什么；还可以了解不同群体间物种分布有何差异，结合样本来源和其所属环境，指导下游的实验方向。于科研，好的群体和样本可以发表质量的学术论文；于临床，可以辅助临床医生进行微生物侵染类疾病诊断并在一定程度提供用药指导。随着数据库日趋完善，对样本进行宏病毒组测序以后，我们将获得越来越丰富的信息，它有朝一日会成为研究者非常常规的研究手段。上海探普生物科技有限公司立志专门解决病毒方向的基因组研究难题，开发了整套的样本处理和生信分析流程，基于这套流程，研究者们想对样本进行宏病毒组测序就很容易实现了。

在探普生物进行病毒宏基因组测序流程是怎么样的？

在探普生物进行病毒宏基因组测序的流程非常简单，简而言之，客户只需要说清楚样品情况，准备样品即可，其他事宜都由探普来进行安排。大致流程如下：

1)与销售人员沟通项目需求和样本情况；

2)探普生物工作人员拟定项目合同，双方协商合同内容后签字盖章；

3)按样本准备指南准备好样本，填写信息单后通知销售人员预订干冰，安排样本寄运输；

4)客户支付项目启动款，探普生物启动项目实验和分析并提供测序报告；

5)客户支付项目尾款，探普生物提交测序数据和分析结果；

6)售后问题处理，项目结题。

在探普生物进行病毒宏基因组测序，样品具备什么条件才可以获得比较质量的宏基因组分析效果？

其他公司对用于测序的样本的要求较高。而在探普生物进行病毒宏基因组测序，基于探普的专有流程，样本要求非常低，不要求总量到达微克，探普有专门的收样标准和送样流程。为了保证后续数据的有效利用率，需要客户配合完成合格的取样步骤和样本前处理步骤。当然探普也提供适当的样本处理服务。核酸性质有RNA和DNA之分，核酸链还有单双链之分，而核酸本质不同和单双链的不同，进行同样的实验步骤其效率也不一样。这些特点决定了宏基因组测序是相对个性化定制化的一类服务，出于对结果真实性的尊重和保证，需要客户和销售人员充分沟通，设定合理的样本处理方案。

上海探普生物科技有限公司对样本进行宏病毒组测序实验是如何进行的？

探普生物对样本进行宏病毒组测序实验基于二代测序技术。经过核酸纯化-文库构建-生物信息学分析这3大基本流程后，样本转换成了序列数据。首先，在核酸纯化环节，探普提供专门针对病毒的核酸纯化样本指南，以提高纯度和得率，与此同时探普生物也提供核酸纯化服务。第二，文库构建环节。样本的核酸具备浓度低，总量少的特点。探普生物专门针对这一点开发了超微量核酸文库构建，可以将0.01ng/μl甚至更低浓度的核酸构建成测序文库。第三，生物信息学分析环节。寄生性质的生物下机数据一般都伴随大量的宿主和其他微生物的数据。探普生物基于该特点，优化了自有数据库，搭载了**的生物信息学分析流程，可处理复杂背景下的目标物种序列。