北京逆转录酶
反转录酶的注意事项,在进行RT反应之前,应考虑以下几个方面:RNA:成功的cDNA合成来自高质量的RNA,高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。在提取RNA的过程中,要特别防止RNase的污染,同时在逆转录反应中经常加入RNase抑制剂以增加cDNA合成的长度和产量。RNase抑制剂要在首先链cDNA合成反应中,在缓冲液和还原剂(如DTT)存在的条件下加入,因为cDNA合成前的过程会使抑制剂变性,从而释放结合的可以降解RNA的RNase。蛋白RNase抑制剂只防止RNaseA,B,C对RNA的降解,并不能防止皮肤上的RNase,因此尽管使用了这些抑制剂,也要小心不要从手指上引入RNase,实验过程中经常更换新手套。逆转录酶通常具有多种活性,如逆转录活性、复制活性与RNA酶H活性。北京逆转录酶
M-MLV反转录酶比AMV反转录酶缺乏连续性,因此要获得像AMV反转录酶反应中产生同样量的cDNA就要求使用较多单位的M-MLV反转录酶。用1微克的mRNA起始合成首先条链的cDNA,要用8单位的M-MLV反转录酶才相当于1单位的AMV反转录酶的作用。该酶很容易被亚精胺(Spermidine)所抑制,该酶非常不能用Promega的RiboprobeAMV反转录酶5X反应缓冲液,也不能用Promega的RiboclonecDNA首先条链缓冲液,因为这二种缓冲液均含有亚精胺。逆转录实验可以选择加入RNA合成抑制剂RNAse防止RNA降解和污染,逆转录实验过程需适当的RNA质量,过少或质量不佳将影响扩增效果。苏州快速反转录报价逆转录技术的发展使RNA研究得到极大便利。
反转录酶的注意事项,引物的选择,OligodT:选择OligodT时,要求RNA必须有PolyA,所以真核生物的mRNA都适用。适合长链甚至全长mRNA的RT,所以对RNA样品的质量要求较高,较好不要有明显的DNA污染、RNA降解和RNA断裂。假如想探索新的mRNA进行RT反应,建议推荐使用OligodT引物。使用OligodT引物要比随机引物和特异性引物的稳定性要好。特异性引物:特异性引物只能用你设计引物时的下游引物做RT,引物设计质量影响RT的结果,而且不同引物退火温度本来就不相同,所以按照说明书按照一个温度做不是较佳选择,一般不推荐。
逆转录引物:加尾法逆转录引物的结构并不是想象中那么简单的oligodT,其包含三个关键结构:①为了与PolyA序列互补配对,OligodT序列必不可少。②在OligodT序列的5端,存在一段通用序列,用于qPCR过程中反向引物与cDNA的结合。③OligodT序列的3端存在一个或两个锚定碱基,V或者VN。(兼并碱基,V表示A、G或C,N表示ATCG中的任意一种)。如果没有锚定碱基,逆转录引物中的OligodT就会随机结合到PolyA的任意位置,这样会造成同一miRNA的逆转录产物长度不一,给较后的熔解曲线检测带来麻烦。因此,锚定碱基的作用就是特异性地结合到miRNA上,从而让逆转录引物结合到紧挨着miRNA的那段PolyA序列上。只有这样,才能够保证同一miRNA的逆转录产物大小相同。逆转录的反应条件和反应体系的优化十分重要。
miRNA加尾法逆转录:miRNA加尾法利用基因组中压缩miRNA元件,通过识别不同转录起始位置,将miRNA连接到其前体mRNA上这种方法可以注意到与miRNA相关的各种信息,例如miRNA功能特异性,miRNA的转录条件和miRNA的表达量等。miRNA的逆转录允许科学家们用特定的miRNA测序技术来节省时间。miRNA逆转录,可以检测miRNA的表达以及miRNA与RNA的瓦作关系,还可以检测miRNA的调节的位点。同样,miRNA表达量的研究也能够通过miRNA逆转录来进行,从而帮助我们更好地了解miRNA在细胞信号转导中发挥着重要作用。逆转录实验要使用高质量的反转录酶和逆转录引物,避免引物交叉污染。北京逆转录酶
逆转录实验可以选择加入RNA合成抑制剂RNAse防止RNA降解和污染。北京逆转录酶
miRNA逆转录茎环法:首先需要进行RNA样品制备,可选的方法有:离心柱法抽提(不必去除gDNA);传统Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分别设计。是否采用通用引物视情况而定,正向引物与通用反向引物不会形成二聚体时才能用。取200ul的PCR管,根据所得每组RNA的浓度C,每孔加入1000ng总RNA,按公式1000ng/C计算出所需RNA的体积x。然后按建议的20μL反应体系说明,依次向200μL的PCR管内加入下列试剂:加样结束后,移液器吹打混匀,低速离心数秒。将逆转录PCR管放入PCR扩增仪内,调整参数:37℃15min(反转录反应),85℃5s(反转录酶的失活反应),4℃∞。反应结束后根据实验需要进行荧光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。说明:此处可以选择U6下游引物作为U6的逆转录引物,注意相应地调整无酶水的体积和反应温度。北京逆转录酶
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