北京培养病毒全基因组测序宏基因组

时间:2020年01月22日 来源:

有哪些病毒学研究常用方法? 细胞病变效应(cytopathic effect,CPE):由病毒增殖引起的细胞改变称细胞病变效应。 不同种类病毒可引起不同细胞病变效应。如: ①细胞圆缩、分散、溶解,如肠道病毒、鼻病毒、披膜病毒、痘病毒等; ②细胞融合成多核巨细胞,如疱疹病毒、副粘病毒、呼吸道合胞病毒; ③细胞肿胀、颗粒增多、病变细胞聚集成葡萄状,如腺病毒; ④胞质出现空泡,如SV40细胞; ⑤细胞浆或核内出现嗜酸性或嗜碱性包涵体,一至数个不等; ⑥轻微病变,如正粘病毒、狂犬病毒、冠状病毒和逆转录病毒等; ⑦培养液pH的变化。 探普生物的技术团队具备病毒学及微生物学的学术背景。北京培养病毒全基因组测序宏基因组

检测病毒核酸是病毒学研究常用方法 核酸扩增法 目前多数病毒基因已通过分子克隆技术被明确了核苷酸序列,使得DNA扩增技术逐步发展为常规诊断技术之一。 基因芯片技术又称DNA芯片、生物芯片(biochip)。其原理是:将已知的生物分子探针或基因探针,大规模或有序排布于小块硅片等载体上,与待测样品中的生物分子或基因序列相互作用和并行反应,在激光的激发下,产生的荧光谱信号被接受器收集,计算机自动分析处理数据并报告结果。其优点是:可以一次性完成大量样品DNA序列的检测和分析,解决了传统核酸杂交技术的许多不足。芯片技术在病毒等微生物学诊断和流行病学调查方面有着广阔的应用前景。浙江新物种病毒全基因组测序做得好探普生物病毒测序具备样本准备简单的优点。

病毒的脂质有些什么特点? 许多病毒包膜内存在有脂类化合物,如磷脂、脂肪酸、甘油三酸脂和胆固醇等。这些脂类几乎都是由病毒粒子在细胞内成熟,在细胞膜处以芽生方式释放,直接从寄主细胞膜上得到。病毒脂类存在与病毒的吸附和侵入有关。 囊膜(Envelope):某些病毒在核衣壳外包绕着一层含脂蛋白的外膜,称为“囊膜”。囊膜中含有双层脂质、多糖和蛋白质,其中蛋白质具有病毒特异性,常与多糖构成糖蛋白亚单位,嵌合在脂质层,表面呈棘状突起,称“剌突(Spike)或囊微粒(Peplomer)”。它们位于病毒体的表面,有高度的抗原性,并能选择性地与宿主细胞受体结合,它们促使病毒囊膜与宿主细胞膜融合,侵染性核衣壳进入胞内而导致侵染。囊膜中的脂质与宿主细胞膜或核膜成分相似,证明病毒是以“出芽”方式从宿主细胞内释放过程中获得了细胞膜或核膜成分。有囊膜病毒对脂溶剂和其他有机溶剂敏感,失去囊膜后便丧失了侵染性。

高通量测序在病毒准种研究中如何应用 毛细管电泳法能对大量样本的变异情况进行便捷、精准地检测,但其缺点是如果不进行分子克隆则只能推算准种的复杂性,其异源多链泳动分析法不能和具体克隆建立关联,也就无法区分具体的克隆型。目前,国际病毒学界仍主要采用PCR—克隆—测序—序列比对分析的方法进行准种研究。新一代测序技术的快速崛起为准种的研究提供了新的技术平台,它**为明显的变化是无需克隆这项繁琐的过程,而是使用接头进行高通量的并行PCR、测序反应,并结合微流体技术,利用高性能的计算机对大规模的测序数据进行拼接和分析,它能更全面地研究病毒准种的多样性及丰度。探普生物对于样本准备独特的处理方法指南为后续的分析结果打下了牢固的基础。

高通量测序在病毒准种研究中如何应用 采用高通量测序技术可以研究和鉴定稀有耐药性变异体。HoffmannC等采用不同的方法,将部分感兴趣的区域进行PCR扩增,然后再进行焦磷酸测序,并分析了对照的病毒,去除了假阳性结果,检测出小于整个种群1%的耐药性突变体。耐药突变株的出现是抗病毒治疗中的首要问题。从准种角度分析,任何患者体内的病毒由于不同病毒群复制能力与机体免疫力的相互作用**终达到了种群间的平衡状态,但这种平衡从开始即被打破,药物的选择压力迫使各种病毒种群所占的相对比例发生变化,优势种群和不同的劣势种群发生转换,即出现种群漂变(shift)现象。研究者在项目咨询的时候可以明显感觉到探普生物的专业性。北京培养病毒全基因组测序宏基因组

探普生物接触到的病毒全基因组测序项目有比较丰富的应用场景。北京培养病毒全基因组测序宏基因组

病毒学研究常用方法-病毒侵染的快速诊断 快速诊断主要是指从含有病毒标本及侵染机体的血清中检测病毒颗粒、蛋白抗原、IgM抗体和核酸等,往往在数小时内即可得出结果。 形态学检查 :光学显微镜检查 包涵体:电子显微镜检查 病毒抗原检测可以使用ELISA 病毒核酸检测可用核酸杂交、凝胶电泳技术 、PCR 血清学诊断可使用病毒蛋白抗原检查 用荧光素、放射性同位素、过氧化物酶等标记抗体,采用免疫学和分子生物学技术,检测标本中的病毒蛋白抗原,具有敏感、特异、快速等优点。 1.免疫荧光技术 (immunofluorescence,IF) 2.固相放射免疫测定 (solid-phase radioimmunoassay,SPRIA) 3.酶免疫技术 (enzyme immunoassay,EIA)此法可检测多种病毒及其抗体,主要是酶免疫组化法和酶联免疫吸附试验法(ELISA)。北京培养病毒全基因组测序宏基因组

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