浙江拷贝数变异数字PCR活动

肺*的ALK融合基因检测：ALK融合基因是NSCLC患者另外一个常规的伴随诊断，可以指导ALK-TKI药物的使用，目前已发现20种以上EML4-ALK的融合形式，多个报道证实它们中大部分能促进**生成。另外ALK还可能与TFG、KIF5B、KLC1、PTPN3、STRN等基因发生融合，因此ALK融合突变的诊断具有一定难度。目前临床常规使用的检测手段包括免疫组化（Immunohistochemistry，IHC），荧光原位杂交（Fluorescence in situ hybridization，FISH）以及RT-PCR等三种。这三种方法各具优缺点：IHC相对简单，价格低廉，但是容易受到主观判断的影响；FISH可以检测各种融合类型，但是操作繁琐，价格昂贵；RT-PCR方法的特异性较好，结果客观，但是只能针对已知类型。近期有研究者采用数字PCR，利用ALK基因3’端的过表达来鉴定ALK的融合，该方法既具有PCR方法特异性好、结果客观的优势，同时又不受融合类型的限制，可以检测所有融合型，在与三种传统方法的对比过程中展现出了更好的临床符合率，未来有望成为一种新的常规检测手段。德立替尼***HR+/HER2-转移性乳腺*。浙江拷贝数变异数字PCR活动

数字PCR 的定量方法不依赖于扩增曲线的循环阈值，因此不受扩增效率的影响，也不必采用看家基因和标准曲线，具有很好的准确度和重现性，可以实现***定量分析。在未来十年内，医学保健的目标是提供质量高效的个性化医疗。PCR 方法会在实现这个目标的过程中发挥重要作用。相比于传统的PCR，数字PCR 技术有着无可比拟的优势和***的应用前景。应用领域：突变/稀有变异检测（Mutation/Rare variant detection）拷贝数变异（Copy-number variation）进入外周循环（包括血液和粪便）的**组织核酸分析无创产前筛查转化移植检测药理学（Pharmacogenetics）基因表达分析（Geneexpression analysis）-特别针对单细胞或少量细胞或者血清血浆样品线粒体拷贝数分析与线粒体突变分析数字PCR可以验证二代测序(NGS)。湖北准确数字PCR低丰度DNA模板分子的精确定量。

PCR扩增效率的高低直接影响**终信号的判读和实验结果分析。在进行热循环实验时，需检查样品的密封性以及PCR反应板是否和PCR仪热盖完全接触，确保PCR过程中样品反应液没有蒸发。QIAcuity数字PCR系统采用**的微反应腔室封闭方式，固态的物理分割和封闭可有效避免PCR过程中微反应体系的水分蒸发，确保微反应体系中样本反应液浓度的恒定，更易实现准确和精确的定量。原始数据中往往发现阳性信号与阴性背景之间存在许多弱阳性信号。因此需要对引物探针进行重新设计和优化（详见引物探针优化设计）或提升退火温度（探针通常比引物高5~10℃），以消除疑似荧光信号的“雨区“现象；此外，阳性信号和阴性背景间隙过小，导致**终结果无法准确判读。因此需要调整引物探针浓度（建议总反应体系引物浓度为600~800nM；探针浓度为200-400nM）或5' 端**个碱基如有G出现，则将其互补序列设计为实验所用探针，以提高阴阳性信号间隙，便于分析结果的准确判读。

常规PCR和实时荧光PCR定量检测都需要已知拷贝数的标准DNA制定标准曲线，由于样品测定在各种条件上不会完全一致，会造成PCR扩增效率的差异，从而影响定量结果的准确性。而ddPCR不受标准曲线和扩增动力学影响，可以进行***定量。dPCR也有一些缺点，数字PCR系统成本高，通量有限、操作繁琐等不足。芯片式dPCR由于芯片加工成本高，系统复杂度高，使得商业化优势不是特别明显，特别是目前大多数分子诊断qPCR也能够很好的满足需求，dPCR增加的收益成本比并不算高。液滴式相对芯片式成本有所下降，但典型的液滴式dPCR液滴形成和PCR扩增和检测都分别在不同仪器中完成，增加了很多操作，也增加了系统的复杂性，从这点上看全自动荧光定量PCR做的更好。定量方法不依赖于扩增曲线的循环阈值。

数字PCR作为新一代PCR技术，采用芯片载体将PCR反应体系分配到20000个微孔中，实现单分子模板的扩增，通过荧光信号的有无来判断每个微孔的阴阳性**终利用泊松分布校正结果给出***定量值（copy/ul），利于精细定量样品中的拷贝数，且灵敏度高（0.1%），即使针对血液中低频的ctDNA检测也同样适用。数字PCR技术在血液cfDNA低突变丰度检出中的出色表现，以及涵盖多种变异形式（SNV、InDel、融合和扩增）的检测能力，均证明其作为液体活检领域的重要“神技”，可广泛应用于医疗机构、临检中心和科研院所等。肺*T790M突变-cfDNA动态监测。浙江核酸拷贝数定量数字PCR活动

可以用来验证二代测序(NGS)。浙江拷贝数变异数字PCR活动

数字PCR采用的策略概括起来非常简单，就是“分而治之”（divide and conquer），这种做法非常类似于计算机科学中的“分治算法”，将一个标准PCR反应分配到大量微小的反应器中，在每个反应器中包含或不包含一个或多个拷贝的目标分子( DNA模板) ，实现“单分子模板PCR扩增”，扩增结束后，通过阳性反应器的数目“数出”目标序列的拷贝数。在实际的数字PCR实验中，事实上是通过呈现两种信号类型的反应器比例和数目进行统计学分析，计算出原始样本中的模板拷贝数。浙江拷贝数变异数字PCR活动